В АО «МРЭК» внедрена и сертифицирована Интегрированная система менеджмента (ИСМ), которая включает в себя:

- Систему менеджмента качества (международный стандарт ISO 9001:2015);

- Систему экологического менеджмента (международный стандарт ISO 14001:2015);

- Систему менеджмента профессиональной безопасности и охраны труда (международный стандарт ISO 45001:2018);

- Систему энергетического менеджмента (международный стандарт ISO 50001:2018).

При внедрении международных стандартов по системам менеджмента методические и консультационные услуги оказывало ТОО «Казахстанская организация качества».

Органы по сертификации, проводившие сертификационный аудит:

ТОО «QSCert Qаzаqstаn».

ТОО «QSCert Qаzаqstаn» выдал сертификаты соответствия требованиям международных стандартов: ISO 9001:2015, ISO 14001:2015, ISO 50001:2018, ISO 45001:2018. Данные сертификаты являются признаваемыми во всем мире.

ИСМ устанавливает необходимость: разработки Политики и Целей по трем системам менеджмента, распределения ответственности, планирования процессов, выделения необходимых ресурсов, установления требований к продукции, процессам и услугам, обеспечения условий выполнения требований, контроля за их выполнением, анализа и постоянного улучшения деятельности.

В АО "МРЭК" принята Политика в области качества, охраны окружающей среды, профессиональной безопасности и охраны труда. Цели в области качества, охраны окружающей среды, профессиональной безопасности и охраны труда предприятия принимаются и оформляются ежегодно.